ねこすたっと

ねこの気持ちと統計について悩む筆者の備忘録的ページ。

2022-10-01から1ヶ月間の記事一覧

Multivariate?Multivariable?多変量?多変数?

"Multivariate" と "Multivariable" 「多変量」と「多変数」 おわりに 参考資料 「1つの結果変数と2つ以上の説明変数を含んだ回帰分析」を何と呼ぶべきかについての備忘録。 "Multivariate" と "Multivariable" この問題については、以下のHidalgo氏とGoodma…

対応のない2群の代表値を比較するときに用いるべき検定方法

正規性の検定は必要? 等分散の検定は必要? サンプル数はどれくらい必要? おわりに 参考資料 「治療Aを受けた10人と治療Bを受けた10人で、1か月後の検査値Xがどちらが高いか?」というように、対応していない(同じ人でない)2群の連続変数の代表値(平均…

t分布とt検定を振り返る

T統計量とt分布 1標本のt検定(One-sample t test) 対応のあるt検定(paired t test) 対応のない2標本のt検定(Unpaired two-sample t test) おわりに 参考資料 T統計量とt分布 正規分布する母集団から標本 が得られたとき、つまり、 のとき、 が互いに独…

2×2表で関連性をみるための正確検定(Exactパッケージ)[R]

Fisher正確確率検定(Fisher's exact test) Fisher正確確率検定の問題点 固定されている周辺度数いろいろ 行も列も固定されているケース 行(あるいは列)のみ固定されているケース 合計数のみ固定されているケース Fisher正確確率検定の過剰な保守性に対処…

時間依存性共変量をスーパーランドマークモデルを使って解析する(dynpredパッケージ)[R]

ランドマーク(LM)解析とは スーパーランドマーク解析とは 必要なパッケージとデータの読み込み 使用するスーパーランドマーク解析の概要 cutLM( )を使ってLM解析用データセットを準備する。 おわりに 参考資料 ランドマーク(LM)解析とは Immortal time b…

RでTeX表記を使う(latex2expパッケージ)[R]

Tex( )でLaTeX表記を使う LaTeX表記の方法 おわりに 参考資料 文字や図版などの要素を紙面に配置するという作業を「組版」というが、TeXはこの作業を行うために開発された言語。 LaTeX(ラテフ, ラテク)はTeXを使いやすくした無料の文書処理システムで、数…

ZoteroとDropboxを使って文献管理(使い方編)

はじめに 文献を追加する PubMedやGoogle Scholarから追加する 手元のPDFを追加する 文献の情報を管理する 情報 メモ タグ 関連アイテム 文献を整理する 文献を引用する Citationの挿入・編集 Bibliographyの挿入・編集 引用スタイルの変更 更新ボタン 内蔵…

ZoteroとDropboxを使って文献管理(設定編)

はじめに Zoteroとは 準備するもの Zoteroアカウントを登録する Zoteroをインストールする ZotFileをダウンロードする Zoteroの設定をする 環境設定:一般 環境設定:同期 環境設定:引用 環境設定:詳細 表示 ZotFileの設定 Zotero connectorの設定 Safari…

反復処理でサブグループ解析を一括で行う(tidyverse系purrrパッケージ)[R]

サブグループ解析とは、全体からある特性を持った一部の集団(例:男性)を取り出して解析をすること。ランダム化が崩れたり、解析対象集団のサイズが小さくなるから検出力が落ちたり、多重検定の問題が生じたり、と色々注意はある。 でもこの記事では、そこ…

幾何平均(geometric mean)の信頼区間を求める(Gmean関数)[R]

はじめに 幾何平均の信頼区間 Gmean( )を使って計算する おわりに 参考資料 はじめに 平均と言えば大体は「算術平均(arithmetic mean, AM)」のこと。全部足して、要素の個数Nで割る。 これに対して、「幾何平均(geometric mean, GM)」は全部掛け合わせて…

ランドマーク解析を使ってimmortal time biasに対処する(dynpredパッケージ)[R]

Immortal time biasとは ランドマーク(LM)解析とは dynpredパッケージを使ってシンプルなLM解析を行う 必要なパッケージの読み込みと模擬データ作成 元データを通常どおり解析する cutLM( )を使ってランドマーク解析を行う cutLM( )を使わない場合 おわり…