ねこすたっと

ねこの気持ちと統計について悩む筆者の備忘録的ページ。

time-dependent

時間依存性共変量をスーパーランドマークモデルを使って解析する(dynpredパッケージ)[R]

ランドマーク(LM)解析とは スーパーランドマーク解析とは 必要なパッケージとデータの読み込み 使用するスーパーランドマーク解析の概要 cutLM( )を使ってLM解析用データセットを準備する。 おわりに 参考資料 ランドマーク(LM)解析とは Immortal time b…

ランドマーク解析を使ってimmortal time biasに対処する(dynpredパッケージ)[R]

Immortal time biasとは ランドマーク(LM)解析とは dynpredパッケージを使ってシンプルなLM解析を行う 必要なパッケージの読み込みと模擬データ作成 元データを通常どおり解析する cutLM( )を使ってランドマーク解析を行う cutLM( )を使わない場合 おわり…

生存時間データ分類(2):Repeated type(tmerge関数)[R]

最終的に必要なデータ構造 tmerge( )でデータ整形する 3つのデータを用意する tstart, tstopを追加する 時間依存性共変量データを追加する イベント発生データを追加する 累積回数を追加する Cox比例ハザードモデルで解析する おわりに 参考資料 生存時間デ…

生存時間データ分類(1):生存時間データには4つのタイプがある

イベント1種類, 1人1回まで(単純型, simple type) イベント1種類, 1人2回以上可(反復型, repeated type) イベント複数種類, 1人1回まで(競合型, competing type) イベント複数種類, 1人2回以上可(多状態型, multi-state type) おわりに 参考資料 The…

比例ハザード性の仮定が成立しているか検証する[R]

パッケージとデータの準備 補対数-対数プロットを使って検証する Schoenfeld残差を使って検証する ggcoxdiagnostics( )を使って残差プロットを描く 時間依存性共変量を使って検証する おわりに 参考資料 Cox比例ハザードモデル(Cox proportional hazard mod…