傾向スコア解析(3)：傾向スコアマッチング（PSM）を使って交絡を調整する [R]

quasi-experiment prediction/diagnostic matching/paired R

パッケージとデータの準備マッチング前のデータで共変量のバランスを確認する傾向スコアでマッチさせたコホートを作成するマッチさせたコホートで共変量のバランスを確認するマッチングの様子を図示する治療効果を推定するおわりに参考資料傾向スコ…

傾向スコア解析(2)：傾向スコアを使った逆確率重み付け法（IPW）で交絡を調整する [R]

quasi-experiment prediction/diagnostic maths/theory R neco

パッケージとデータの準備〜傾向スコアの推定各症例の重み（weight）を計算する重みが極端な値の場合の対処方法 WeightItパッケージを使う方法共変量のバランスを確認する cobaltパッケージを使う MatchItパッケージを使う治療効果を推定するおわりに…

quasi-experiment prediction/diagnostic validation R

傾向スコアを使った解析の流れ傾向スコアの推定方法傾向スコアの推定に用いる変数パッケージとデータの準備元データで群間のバランスを見てみるロジスティック回帰モデルを使って傾向スコアを推定する推定された傾向スコアを確認する傾向スコアの分布…

missing data handling quasi-experiment R

補完値の収束状況を確認する complete( )を使って補完後のデータセットを抽出する補完データと元データの分布を比較する欠測発生の傾向スコアを使うおわりに参考資料欠測に対して適切な値が代入されたかを評価する。まずはnhanes2データを使って補完デ…